चलिते चलिते आया याजापुर ग्राम
वराह ठाकुर देखि करिला प्रणाम
नृत्य-गीत किला प्रेमे बहुता स्तवन
याजापुरे से रात्रि करिला यापन
"चलते चलते, श्री चैतन्य महाप्रभु और उनके दल अंततः वैतरणी नदी पर याजापुर पहुंचे। वहां उन्होंने वराहदेव के मंदिर को देखा और उन्हें प्रणाम किया। वराहदेव के मंदिर में, श्री चैतन्य महाप्रभु ने मंत्रोच्चार और नृत्य में भाग लिया और प्रार्थना की। उन्होंने उस रात मंदिर में बिताई।"
श्री चैतन्य-चरितामृत में एक संकेत है कि महाप्रभु दूसरी बार याजापुर आए थे। जिस वर्ष श्रीमन महाप्रभु का श्रील गदाधर पंडित गोस्वामी प्रभु के साथ नीलाचल में एक निवासी संन्यासी के रूप में रहने को लेकर विवाद हुआ था, श्री गौरसुंदर श्री राया रामानंद और दो महापात्रों, मंगराज और हरिचंदन के साथ याजापुर आए थे। महाप्रभु ने उसके बाद याजापुर में दो महापात्रों को विदा किया। (श्री चैतन्य-चरितामृत, मध्य-लीला, अध्याय सोलह, श्लोक 150 देखें।)
श्री वराहदेव की दो पत्थर की मूर्तियाँ एक-दूसरे से जुड़ी हुई हैं। मूर्तियों के बाईं ओर श्री लक्ष्मी की एक पत्थर की मूर्ति है, और उनके बाईं ओर श्री जगन्नाथदेव की एक मूर्ति है। उनके सामने धातु से बनी लक्ष्मी-वराह देवताओं का एक छोटा समूह है। याजापुर रोड रेलवे स्टेशन से वराहदेव मंदिर की सत्रह मील की यात्रा करने के लिए तीन बसें लेनी पड़ती हैं और दो नदियों को पार करना पड़ता है। दोनों नदियों के दोनों किनारों पर यात्रियों को ले जाने के लिए कनेक्टिंग बसें प्रतीक्षा कर रही हैं। एक बस में नौ मील की यात्रा करने के बाद, यमुना खाई नामक पहली नदी को पार किया जाता है। फिर बुढ़ा नामक अगली नदी तक छह मील पैदल चलना पड़ता है। इस नदी को पार करने के बाद, एक कनेक्टिंग बस पकड़ता है। याजापुर में राधाबाई धर्मशाला या जगन्नाथ धर्मशाला नाम से एक धर्मशाला है। यह जगन्नाथ के प्राचीन मंदिर के पास स्थित है। श्री चैतन्य के पदचिह्न 25 दिसंबर, 1930 को याजापुर में स्थापित किए गए थे। इसका विस्तृत विवरण के लिए गौड़ीय, खंड 10, भाग 2 देखें।
